Jest rok 1999. W Morioh, zazwyczaj cichym i spokojnym mieście, ostatnio dzieje się wiele dziwnych rzeczy. Kujo Jotaro, który jest biologiem morskim, przyjeżdża do tego tajemniczego miasta, aby spotkać Higashikatę Josuke. Mogą wydawać się obcymi sobie ludźmi, jednak Josuke jest tak naprawdę synem z nieprawego łoża dziadka Jotaro, Josepha Joestara. Gdy się spotykają, Jotaro uświadamia sobie, że mają ze sobą więcej wspólnego niż się wydaje.
Razem z łagodnym Hirose Koichim i narwanym Nijimurą Okuyasu, badają przyczyny ostatnich dziwnych zdarzeń w Morioch. Dzięki mocy ich Widmowych Fal cała czwórka stawia czoła zagrożeniom czyhającym na nich z każdej strony. Tylko oni mogą odkryć sekrety stojące za dziwnymi wydarzeniami w mieście, zanim dojdzie do kolejnych incydentów.